Adgang til forskningsdata, analyseværktøjer og beregningskapacitet

Har du brug for en sikker adgang til pseudonymiserede patientdata fra Sundhedsplatformen eller specialsystemer i regionen, så har du følgende muligheder: 

DAP – data fra SP og andre datakilder samt analyse- og udviklingsværktøjer 

Regionens cloud-baserede forskerplatform DAP (Data- og analyseplatformen) giver adgang til kopi af data fra en række af regionernes datakilder, fx Sundhedsplatformen (SP) og billeder fra RIS/PACS. Laboratoriesvar kommer via SP. 

DAP giver desuden adgang til en række værktøjer til analyse samt udvikling og træning af machine learning-modeller på store datasæt, fx Python, R og SAS (sidstnævnte er under etablering – pr. august 2024). 

Dataudtræk bestilles ved at oprette en sag i CIMT Serviceportal. Herefter to veje: 

  • Hvis bare simpelt dataudtræk, som er helt klart specificeret: SP Sundhedsdata-enheden lægger dataudtrækket op i et virtuelt arbejdsområde til forskningsprojektet. 
  • Hvis ikke helt simpelt og klart specificeret: SP Sundhedsdata-enheden inviterer til afklarende møde med forskeren.

Pris

  • Det er gratis at få leveret datasæt til forskning, med undtagelse af de helt store projekter. 
  • Alle projekter, uanset størrelse, betaler for compute i det virtuelle arbejdsområde i Cloud, dvs. at de bliver faktureret for den aktivitet, de har på platformen. Beløbet dækker prisen for strøm, som regionen betaler hos Microsoft. 
  • Der betales p.t. ikke for lagerplads (storage). 

Antal brugere

Der er ikke nogen begrænsning på, hvor mange forskere der kan få adgang til data og selv udvinde rapporter på projektets virtuelle arbejdsområde. 

Forudsætninger for at få adgang til forskningsdata 

  • At forskeren/bestilleren er oprettet som Region H-bruger
  • At juridiske godkendelser og samtykker er på plads. Hvis SP Sundhedsdata-enheden i det konkrete projekt bliver bedt om data, som p.t. ligger uden for DAP-rammen, tager enheden kontakt til regionens informationssikkerhedsenhed for at få godkendelse, fx til udtræk af genomdata. 

Begrænsninger eller forbehold

  • Arbejdet i DAP Forskerservice egner sig bedst til avancerede forespørgsler og kræver typisk, at projektet selv har data scientist-kompetencer eller kan betale sig til det hos SP Sundhedsdata, AI-teamet. For mere simple forespørgsler kan Slicer Dicer være en bedre løsning – se nedenfor. 
  • På et tidspunkt indføres måske betaling for (lagerplads) storage, fx hvis der er tale om store mængder billeddata. 

Adgang til data fra nationale registre

SP Sundhedsdata-enheden kan ud over data fra regionens datakilder også uploade data fra nationale registre i DAP’en og lægge dem til rette sammen med data fra SP og/eller andre regionale datakilder. 

 

Slicer Dicer - data fra Sundhedsplatformen og rapporteringsfunktionalitet

Har du brug for aggregerede data fra Sundhedsplatformen og mulighed for at sammenstillede rapporter, kan du benytte Slicer Dicer: 

Slicer Dicer er et værktøj inde i Sundhedsplatformen, der kan benyttes som redskab til at formidle og analysere SP-data. Du kan i SlicerDicer se aggregerede og pseudonymiserede data for samtlige (p.t.) 3,2 mio. patienter i begge regioner (pseudonymiserede data kræver, at man ikke arbejder med forskning). Disse kan filtreres og fordeles på blandt andet hospital, afsnit, diagnose eller procedure. Du kan også lave en kombination af disse oplysninger. 

Du kan fx få en løbende oversigt over patienter på et afsnit, overafdeling, hospital eller region med en given diagnose eller procedure.

SlicerDicer fungerer som en integreret del af SP, og dine private SlicerDicer-sessioner kan deles med kolleger, der også har adgang til SlicerDicer. Derudover kan du lave dit eget dashboard med komponenter, du har lavet i SlicerDicer. 

Velegnet til at teste en klinisk tese om udvikling. 

Begrænsninger eller forbehold

  • Egner sig til medarbejdere, der ikke ønsker at kode deres egne forespørgsler 
  • Du skal være oprettet som Region H-bruger
  • Kan blive avanceret/teknisk ned i kliniske termer og logikker.

Se vejledning til SlicerDicer på regionens intranet

 

DTU

Dette skal afdækkes og aftales med det institut på DTU som projektet køres sammen med, for at finde den bedste løsning.

For spørgsmål kontakt:

Alberte Holm Glob

Alberte Holm Glob Chefkonsulent Afdeling for Forskning, Rådgivning og Innovation